然而,事情并没有这么简单。远涉重洋,不远万里,到一个遥远的国度传教谈何容易。虽然郁约翰为医疗传教这个新使命而激动不已,但付诸实施却大费周折。首先经费就是个大问题。1886年春天,郁约翰以医学博士毕业于密西根大学,准备远航厦门。当他作为医疗传教士出现在纽约市归正教堂委员会(R.C.A. )面前的时候,他们显得非常吃惊,对他说我们没有资金给你也不可能提供建立一个医院的经费。巨大的失望并没有使郁约翰放弃目标。在他父亲的朋友,荷兰Netherlands 的Neerbosh孤儿院院长Van’t Lindenhout先生的力促下,郁约翰到荷兰阿姆斯特丹大学和乌得勒支大学(Universities of Amsterdam and Utrecht)进行博士后医学研究。虽然郁约翰在医学方面已造诣颇深,但他依然缺少资金,直到在Van’t Lindenhout先生的极力鼓动下,郁约翰鼓足勇气给孤儿院的小朋友发表了一次演讲。当郁约翰用并不美妙的嗓音结束演讲时,一个小姑娘走到他面前,双手握着两枚半个荷兰便士,对他说:“给那些生病的中国小孩!”而这两枚半个荷兰便士是小姑娘生日前一天她叔叔送给她的生日礼物。正是这次演讲使郁约翰下定决心,义无反顾。
在郁约翰服务厦门的15年中,共诊治住院病人16000人,门诊病人125000人,做了7000例以上的手术。另据何丙仲翻译的美国牧师A.L.Warnshuis, M.A.《郁约翰生平述略》(A BRIEF SKETCH OF THE LIFE AND WORK OF DR .JOHN A. OTTE,1911)显示,救世医院开办的12年(1898-1910)中,共收治17000多名住院病人,135000多名门诊病人,做了7500多例手术。潘维廉教授在他的《魅力鼓浪屿》中说,1900年,郁约翰两座医院(男女医院)共接待病人10200名,治疗1206名住院者,施行631例手术,拔牙155颗。